formation proposée par Service formation continue Université Via Domitia UPVD

Licence professionnelle biotechnologies, spé bioinformatique : traitement de donnees genomiques

Biologie :
- Connaître les programmes de séquençage et d'analyse des données relatives aux génomes, exploiter les bases de données existantes
- Assimiler les notions sur les différents ARN et leur importance dans les processus biologiques, les techniques des puces à ADN, de PCR en temps réel, les méthodes de clustering, …
- Acquérir les compétences en matière d'interactions protéine-protéine, de protéome, de techniques d'electrophorèse en 2D, de spectrométrie de masse, …
Bioinformatique :
- Savoir utiliser les principaux algorithmes bioinformatiques (Needlemen & Wunsch, Smith & Waterman, Blast et Fasta, …)
- Analyser les séquences
- Etudier la phylogénie
- S'initier à la modélisation moléculaire
- Savoir exploiter les différentes banques de données selon leurs formats de données
Informatique :
- Modéliser les bases de données (Merise) et Interroger les Données (SQL)
- Programmer en Orientée Objets, développer des interfaces graphiques (Java)
- Programmer en VBA sous Excel, et sous OpenOffice
- Développer des applications Web : PHP, Java script, PostGre SQL, MySQL, JSP
- Connaître le langage Perl
- Connaître les systèmes d'exploitation Windows, LINUX, savoir écrire des scripts shell
- Savoir faire communiquer des bases de données hétérogènes (ODBC)
Statistique :
- Maîtriser la statistique inférentielle
- Connaître les outils de classification
- Assimiler les méthodes de Data Mining, Text Mining, Biostatistique
Communication :
- Communiquer à l'aide d'outils informatiques : Power Point (PréAO), éditeurs de pages HTML, Frontpage, utilisation d'Internet, prises de notes et synthèse de réunion
- Connaître l'anglais professionnel.

Descriptif des composantes de la certification :
Durée du parcours : 1 année
Nombre d'UE : 7 UE (dont projets tuteurés et stage)
La certification s'obtient après une évaluation sur 19 champs distincts concernant les unités suivantes :
Enseignements d'harmonisation (UE1 – 4 ECTS) : Algorithmique et Programmation Modélisation et Interrogation de bases de données Biologie cellulaire
Biologie Moléculaire (UE2 – 6 ECTS) : Outils de la biologie moléculaire ARN Protéines Cultures cellulaires Etudes fonctionnelles
Bioinformatique (UE3 – 8 ECTS) : Analyses de séquences Etude du processus allant du gène à la fonction
Informatique (UE4 – 10 ECTS) : Développement Web Développement d'IHM Développement d'application pour l'analyse de séquences
Statistique (UE5 – 4 ECTS) : Analyse Factorielle Classification
Formation Générale (UE6 – 6 ECTS) : Communication Anglais professionnel
Formation Professionnelle (UE7 – 22 ECTS) : Soutenance de projet Soutenance de stage

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